Ο ρόλος του αγριόγιδου στα οικοσυστήματα των μεγάλων βουνών  της Ελλάδας είναι ιδιαίτερα σημαντικός. Όταν το αγριόγιδο βρίσκεται σε μεγάλους αριθμούς, μπορεί και στηρίζει τροφικά τους πληθυσμούς ανώτερων θηρευτών, όπως του λύκου και του λύγκα.  Έτσι, κατ αυτόν τον έμμεσο  τρόπο, συνεισφέρει ακόμα και στη μείωση των ζημιών στο ζωικό κεφάλαιο που υφίστανται τα κοπάδια των κτηνοτρόφων από τα άγρια σαρκοφάγα. Ένας ακόμα φυσικός θηρευτής του αγριόγιδου είναι ο χρυσαετός, ο οποίος μπορεί να συλλάβει τα μικρά αγριόγιδα του πρώτους μήνες της ζωής τους.

    Σε ορισμένα μεγάλα ορεινά συγκροτήματα του εξωτερικού, όπου υπάρχουν αξιόλογοι πληθυσμοί αγριόγιδων, αρκετά ζώα πεθαίνουν εξαιτίας των δυσμενών συνθηκών κατά τη διάρκεια του χειμώνα. Τα κουφάρια αυτών των νεκρών αγριόγιδων  χρησιμεύουν για τροφή των όρνεων, των γυπαετών και των χρυσαετών. Στη χώρα μας τα παραπάνω είδη αρπακτικών πουλιών κινδυνεύουν να εξαφανιστούν είτε από την περιορισμένη διαθέσιμη τροφή είτε από την κατανάλωση δηλητηριασμένων δολωμάτων που τοποθετούνται ενίοτε παράνομα στη φύση από «αγνώστους».